Systèmes d’électrophorèse de laboratoire : comment séparer ADN, ARN ou protéines de façon reproductible ?

Qu’il s’agisse de caractériser un extrait protéique, de génotyper un isolat ou de valider une purification, l’électrophorèse reste un standard universel du laboratoire. Nos systèmes d’électrophorèse couvrent la séparation d'ADN/ARN sur gel d’agarose, des protéines en SDS-PAGE, l'IEF et les transferts type Western blot. Conçus pour la précision et la sécurité, ils associent cuves horizontales et verticales, accessoires de coulage, peignes et plateaux, plus une alimentation électrique programmable. Objectif : reproductibilité, clarté des bandes et productivité au quotidien.

Quels sont les différents systèmes d’électrophorèse et comment choisir ?

Pour l'ADN/ARN, les systèmes horizontaux exploitent des gels d’agarose faciles à couler via des plateaux et peignes modulant le nombre et la largeur des puits. Ils privilégient un faible volume de tampon, des capots sécurisés et des guides de coulée anti-fuite pour une préparation rapide et propre.

Pour les protéines, les systèmes verticaux 1D (SDS-PAGE ou native) utilisent des plaques de verre et des chambres de coulage garantissant l’étanchéité pendant la polymérisation. Des options de refroidissement maintiennent la résolution des bandes et la reproductibilité. Les gels en gradient élargissent la gamme de masses séparées.

En 2D/IEF, la première dimension isofocalise les protéines sur un gradient de pH (strips IPG), la seconde sépare par masse en PAGE. Les cellules d’IEF précises pilotent température, rampes de tension et homogénéité du champ.

Les systèmes de transfert (bain humide ou semi-sec) déplacent les protéines vers membranes PVDF/nitrocellulose pour les Western blots : le semi-sec est rapide et économe en tampon, le bain humide excelle sur gros complexes.

L'alimentation électrique (générateur) fournit tension/courant constants, profils programmables, temporisation et sécurités (couvercle, détection charge). Les sècheurs de gels facilitent archivage et autoradiographie.

Critères de choix : format de gel, capacité d’échantillons, uniformité du champ, dissipation thermique, volume de tampon, compatibilité gels précoulés, ergonomie du coulage, sécurités, traçabilité et budget.

Type	Principe	Applications/Avantages
Horizontal agarose	Migration d’ADN/ARN dans agarose	Génotypage, PCR check, faible coût, mise en œuvre rapide
Vertical 1D (PAGE)	SDS-PAGE/native entre plaques	Profil protéique, pureté, haut pouvoir séparateur
2D + IEF	pI puis masse (IEF ? PAGE)	Protéomique fine, résolution d’isoformes, pI précis

Dans quels domaines utilise-t-on un système d’électrophorèse ?

• Sciences de la vie : contrôle d’insert, CRISPR, qualité de libraries, profils SDS-PAGE, Western blot.
• Pharmaceutique/biotech : suivi de purification, agrégats, isoformes, IEF des anticorps, libération de lots.
• Agroalimentaire : traçabilité ADN, détection OGM, authentification d’espèces, contrôle de contaminants.
• Environnement : eDNA, empreintes microbiennes, surveillance de biodiversité.
• Cosmétique : contrôle de protéines/enzymes, vérification de pureté de matières premières.
• Chimie/contrôle qualité : caractérisation de mélanges chargés, suivi de synthèse, formation.
En enseignement, les cuves horizontales à faible volume offrent un excellent rapport pédagogie/sécurité.

Les différents systèmes et accessoires d’électrophorèse disponibles

Questions fréquentes sur les systèmes d’électrophorèse

Horizontal ou vertical, que choisir ?
: Horizontal pour l'ADN/ARN en agarose (rapidité, coût). Vertical pour les protéines (SDS-PAGE) avec meilleure résolution.

Quelle alimentation électrique convient ?
: Privilégiez tension/courant constants, pas à pas programmables, minuteur et sécurités de couvercle. La puissance doit couvrir vos cuves et gels.

L’IEF nécessite-t-elle un contrôle thermique ?
: Oui, une température stable et des rampes de tension précises améliorent focalisation, reproductibilité et protection des échantillons.

Transfert semi-sec ou bain humide ?
: Semi-sec = rapide et peu de tampon. Bain humide = plus universel, efficace sur protéines de grande taille ou gels épais.

Comment entretenir les cuves et plateaux ?
: Rincez à l’eau distillée, évitez solvants/agressifs, séchez sans abrasion. Vérifiez joints et câbles pour préserver l’étanchéité et la sécurité.

Les peignes influencent-ils la résolution ?
: Oui. Épaisseur et nombre de dents déterminent le volume par puits et la finesse des bandes. Adaptez au débit et à la sensibilité requise.

Des options pour réduire l’empreinte environnementale ?
: Choisissez cuves à faible volume, programmes optimisés, consommables durables. Gérez tampons et acrylamide selon les filières adaptées.